Emirdağ Devlet Hastanesi İncili Mahallesinde Mithat Paşa İlköğretim okulu yanındaki binada(halen sağlık meslek lisesi olarak kullanılmaktadır.) 1953 yılında başta hastaneye ismini veren Gülsüm Hatun olmak üzere Emirdağlı hayırseverlerin katkısı ile sağlık merkezi olarak faaliyete geçmiş bilahare hastaneye dönüştürülerek 1999 yılma kadar bu binada 25 yatakla hizmetini sürdürmüştür.
Yeni hastane binasının 1991 yılında 50 yataklı olarak temeli atılmış ve uzun bir inşaat sürecinden sonra 1998 yılında 100 yatağa dönüştürülerek bir yılda tamamlanmış ve 1999 yılı Kasım ayında 100 yataklı olarak faaliyete başlamıştır.
17.01.2005 tarihinde hastanemizin diyaliz ünitesi Emirdağ’lı hayırsever hemşehrilerimizin katkılarıyla açılmış olup halen 5 diyaliz cihazı ile 18 hastaya hizmet vermektedir. Küçük bir sağlık merkezi olarak hizmet vermeye başlayan hastanemiz yıllar içerisinde büyüyerek günümüzdeki modern görüntüsüne kavuşmuştur. Bu süre zarfında hasta sayısını giderek artıran hastanemiz 2007 yılında 110.000 hastaya ayaktan poliklinik hizmeti vermiş olup 2973 hasta ise yatırılarak tedavi edilmiştir. Ayrıca 438 hasta hastanemizde hizmet veren Genel Cerrahi, Kadın Doğum ve Kulak Burun Boğaz uzmanlarınca ameliyat edilmiştir.
Hastanemizde sivil savunma çalışmaları kapsamında 17.04.2008 tarihinde personelimizi bilgilendirme ve bilinçlendirme amaçlı yangın tatbikatı yapılmıştır. Hastanemiz sivil savunma temsilcisi Fatih Bekar tarafından yürütülen tatbikat tüm personelin katılımıyla başarılı bir şekilde tamamlanmıştır.